Bio Informatika

Bioinformatika adalah ilmu yang mempelajari penerapan teknik komputasional untuk mengelola dan menganalisis informasi biologis. Bidang ini mencakup penerapan metode-metode matematika, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah biologis, terutama dengan menggunakan sekuens DNA dan asam amino serta informasi yang berkaitan dengannya. Contoh topik utama bidang ini meliputi basis data untuk mengelola informasi biologis, penyejajaran sekuens (sequence alignment), prediksi struktur untuk meramalkan bentuk struktur protein maupun struktur sekunder RNA, analisis filogenetik, dan analisis ekspresi gen.

Bidang Utama

Capture

SUMBER

https://id.wikipedia.org/wiki/Bioinformatika

Hubungan Parallel Processing dengan Komputasi Modern

Parallel Processing

Parallel Processing adalah penggunakan lebih dari satu CPU untuk menjalankan sebuah program secara simultan. Idealnya, parallel processing membuat program berjalan lebih cepat karena semakin banyak CPU yang digunakan.

Tujuan Parallel Processing

Tujuan utama dari parallel processing adalah untuk meningkatkan performa komputasi. Semakin banyak hal yang bisa dilakukan secara bersamaan (dalam waktu yang sama), semakin banyak pekerjaan yang bisa diselesaikan.

Ada 4 model komputasi yang digunakan, yaitu :

– SISD

Merupakan singkatan dari Single Instruction, Single Data adalah satu-satunya yang menggunakan arsitektur Von Neumann. Ini dikarenakan pada model ini hanya digunakan 1 processor saja.

 

– SIMD

Merupakan singkatan dari Single Instruction, Multiple Data. SIMD menggunakan banyak processor dengan instruksi yang sama, namun setiap processor mengolah data yang berbeda.

 

– MISD

Merupakan singkatan dari Multiple Instruction, Single Data. MISD menggunakan banyak processor dengan setiap processor menggunakan instruksi yang berbeda namun mengolah data yang sama.

 

– MIMD

Merupakan singkatan dari Multiple Instruction, Multiple Data. MIMD menggunakan banyak processor dengan setiap processor memiliki instruksi yang berbeda dan mengolah data yang berbeda.

 

Hubungan Parallel Processing dengan Komputasi Modern

Hubungan antara komputasi modern dan parallel processing sangat berkaitan, karena penggunaan komputer saat ini atau komputasi dianggap lebih cepat dibandingkan dengan penyelesaian masalah secara manual. Dengan begitu peningkatan kinerja atau proses komputasi semakin diterapkan, dan salah satu caranya adalah dengan meningkatkan kecepatan perangkat keras. Dimana komponen utama dalam perangkat keras komputer adalah processor. Sedangkan parallel processing adalah penggunaan beberapa processor (multiprocessor atau arsitektur komputer dengan banyak processor) agar kinerja computer semakin cepat.

Kinerja komputasi dengan menggunakan parallel processing menggunakan dan memanfaatkan beberapa komputer atau CPU untuk menemukan suatu pemecahan masalah dari masalah yang ada. Sehingga, dapat diselesaikan dengan cepat daripada menggunakan satu komputer saja. Komputasi dengan parallel processing akan menggabungkan beberapa CPU, dan membagi-bagi tugas untuk masing-masing CPU tersebut. Jadi, satu masalah terbagi-bagi penyelesaiannya. Tetapi ini untuk masalah yang besar saja, komputasi yang masalah kecil, lebih murah menggunakan satu CPU saja.

 

Sumber

https://www.academia.edu/7424831/Parallel_PROCESSING_Pemrosesan_paralel

Komputasi Modern

Komputasi modern adalah sebuah konsep sistem yang menerima intruksi-intruksi dan menyimpannya dalam sebuah memory, memory disini bisa juga dari memory komputer. Oleh karena pada saat ini kita melakukan komputasi menggunakan komputer maka bisa dibilang komputer merupakan sebuah komputasi modern. Konsep ini pertama kali digagasi oleh John Von Neumann (1903-1957). Beliau adalah ilmuan yang meletakkan dasar-dasar komputer modern. Von Neumann telah menjadi ilmuwan besar abad 21. Von Neumann memberikan berbagai sumbangsih dalam bidang matematika, teori kuantum, game theory, fisika nuklir, dan ilmu komputer yang di salurkan melalui karya-karyanya . Beliau juga merupakan salah satu ilmuwan yang terkait dalam pembuatan bom atom di Los Alamos pada Perang Dunia II lalu. Kegeniusannya dalam matematika telah terlihat semenjak kecil dengan mampu melakukan pembagian bilangan delapan digit (angka) di dalam kepalanya.

Dalam kerjanya komputasi modern menghitung dan mencari solusi dari masalah yang ada, dan perhitungan yang dilakukan itu meliputi:

  • Akurasi (big, Floating point)
  • Kecepatan (dalam satuan Hz)
  • ProblemVolume Besar (Down Sizzing atau pararel)
  • Modelling (NN & GA)
  • Kompleksitas (Menggunakan Teori big O)

Karakteristik Komputasi Modern

Komputer-komputer penyedia sumber daya bersifat heterogenous karena terdiri dari berbagai jenis perangkat keras, sistem operasi, serta aplikasi yang terpasang.

Komputer-komputer terhubung ke jaringan yang luas dengan kapasitas bandwidth yang beragam.

Komputer maupun jaringan tidak terdedikasi, bisa hidup atau mati sewaktu-waktu tanpa jadwal yang jelas.

Jenis-jenis Komputasi Modern

Jenis-jenis komputasi modern ada 3 macam, yaitu :

Mobile Computing atau Komputasi Bergerak. Mobile Computing (komputasi bergerak) merupakan kemajuan teknologi komputer, sehingga dapat berkomunikasi menggunakan jaringan tanpa menggunakan kabel serta mudah dibawa atau berpindah tempat, tetapi berbeda dengan komputasi nirkabel.

Beberapa keterbatasan dan resiko dari Mobile Computing:

  • Kurangnya Bandwith Akses internet pada peralatan ini umumnya lebih lambat dibandingkan dengan koneksi kabel.
  • Gangguan Transmisi Banyak faktor yang bisa menyebabkan gangguan sinyal pada mobile computing seperti cuaca, medan dan jarak alat mobile computing dengan titik pemancar sinyal terdekat.

Grid Computing (Komputasi Grid). Grid Computing memanfaatkan kekuatan pengolahan idle berbagai unit komputer dan menggunakan kekuatan proses untuk menghitung satu pekerjaan.

Beberapa daftar yang dapat digunakan untuk mengenali sistem komputasi grid, adalah :

  • Sistem mencoba mencapai kualitas pelayanan yang canggih, yang lebih baik diatas kualitas komponen individu pelayanan komputasi grid.
  • Sistem menggunakan standard dan protocol yang terbuka.
  • Sistem untuk koordinat sumber daya komputasi tidak dibawah kendali pusat.

Cloud Computing atau Komputasi Awan. Cloud Computing adalah perluasan dari konsep pemrograman berorientasi objek abstraksi. Abstraksi, sebagaimana dijelaskan sebelumnya, menghapus rincian kerja yang kompleks dari visibilitas.

Adapun perbedaan antara komputasi mobile, komputasi grid dan komputasi cloud, dapat dilihat penjelasannya dibawah ini :

  • Komputasi mobile menggunakan teknologi komputer yang bekerja seperti handphone, sedangkan komputasi grid dan cloud menggunakan komputer.
  • Biaya untuk tenaga komputasi mobile lebih mahal dibandingkan dengan komputasi grid dan cloud.
  • Komputasi mobile tidak membutuhkan tempat dan mudah dibawa kemana-mana, sedangkan grid dan cloud membutuhkan tempat yang khusus.
  • Untuk komputasi mobile proses tergantung si pengguna, komputasi grid proses tergantung pengguna mendapatkan server atau tidak, dan komputasi cloud prosesnya membutuhkan jaringan internet sebagai penghubungnya.

Dampak adanya komputasi modern

Salah satu dampak dari adanya komputasi modern adalah dapat membantu manusia untuk menyelesaikan masalah-masalah yang kompleks dengan menggunakan computer. Salah satu contohnya adalah biometric. Biometric berasal dari kata Bio dan Metric. Kata bio diambil dari bahasa yunani kuno yang berarti Hidup sedangkan Metric juga berasal dari bahasa yunani kuno yang berarti ukuran, jadi jika disimpulkan biometric berarti pengukuran hidup. Tapi secara garis besar biometric merupakan pengukuran dari statistic analisa data biologi yang mengacu pada teknologi untuk menganalisa karakteristik suatu tubuh ( individu ). Nah dari penjelasan tersebut sudah jelas bahwa Biometric menggambarkan pendeteksian dan pengklasifikasian dari atribut fisik. Terdapat banyak teknik biometric yang berbeda, diantaranya:

  • Pembacaan sidik jari / telapak tangan.
  • Geometri tangan.
  • Pembacaan retina / iris.
  • Pengenalan suara.
  • Dinamika tanda tangan.

Beberapa Contoh Komputasi Modern Sampai Dengan Lahirnya ENIAC 

  • Konrad Zuse’s electromechanical “Z mesin”.Z3 (1941) sebuah mesin pertama menampilkan biner aritmatika, termasuk aritmatika floating point dan ukuran programmability. Pada tahun 1998, Z3 operasional pertama di dunia komputer itu di anggap sebagai Turing lengkap.
  • Berikutnya Non-programmable Atanasoff-Berry Computer  yang di temukan pada tahun 1941 alat ini menggunakan tabung hampa berdasarkan perhitungan, angka biner, dan regeneratif memori kapasitor.Penggunaan memori regeneratif diperbolehkan untuk menjadi jauh lebih seragam (berukuran meja besar atau meja kerja).
  • Selanjutnya komputer Colossus ditemukan pada tahun 1943, berkemampuan untuk membatasi kemampuan program pada alat ini menunjukkan bahwa perangkat menggunakan ribuan tabung dapat digunakan lebih baik dan elektronik reprogrammable.Komputer ini digunakan untuk memecahkan kode perang Jerman.
  • The Harvard Mark I ditemukan pada 1944, mempunyai skala besar, merupakan komputer elektromekanis dengan programmability terbatas.
  • Lalu lahirlah US Army’s Ballistic Research Laboratory ENIAC ditemukan pada tahun 1946, komputer ini digunakan unutk menghitung desimal aritmatika dan biasanya disebut sebagai tujuan umum pertama komputer elektronik  (ENIAC merupaka generasi yang sudah sangat berkembang di zamannya sejak komputer pertama Konrad Zuse ’s Z3 yang ditemukan padatahun 1941).

Sumber :

http://khresnapurnama.blogspot.co.id/2013/03/pengertian-jenis-dan-contoh-komputasi.html

https://grunge2you.wordpress.com/2014/03/27/komputasi-modern/

“Kita Mencapai Target”

Pada awal semester enam kemarin, saya mendapat mata kuliah Penelitian Ilmiah. Sejak awal, saya tidak merasa yakin bisa menyelesaikan penelitian ilmiah ini pada semester tersebut. Namun, penelitian ini merupakan salah satu syarat untuk mendapatkan gelar strata satu. Hal pertama yang saya cemaskan adalah menentukan judul untuk penelitian, kemudian pemahaman yang kurang dalam bahasa pemrograman, dan juga saya merasa tidak siap seandainya terlalu banyak yang direvisi.

Saya pun memulai dengan konsultasi dengan teman di kampus mengenai judul yang sekiranya bisa saya ajukan kepada dosen pembimbing. Hal ini membuat saya panik, karena judul yang saya ajukan nanti belum tentu diterima oleh dosen pembimbing saya. Dan saya harus mencari lagi judul yang sesuai dengan minat dosen pembimbing. Ada masukan dari teman untuk membuat aplikasi android dan membuat Augment Reality. Tapi, menurut saya tema tersebut belum pas dijadikan tema penelitian ilmiah saya, terlebih karena saya merasa tidak yakin bisa mengembangkan tema tersebut. Keputusan terakhir akhirnya saya tetapkan untuk membuat sebuah website “Aplikasi Pendukung Keputusan Laboratorium Teknik Informatika”.

Aplikasi ini adalah aplikasi yang dibuat untuk Universitas Gunadarma. Memilih asisten laboratorium yang berkualitas merupakan hal yang tidak mudah, terlebih jumlah calon asisten yang mendaftar tidaklah sedikit. Untuk mempermudah proses pemilihan asisten tersebut, maka saya merancang aplikasi berbasis web ini dengan menggunakan metode Profile Matching. Aplikasi ini dibuat dengan menggunakan bahasa pemrograman PHP yang mudah dipelajari dan MySQL untuk pengolahan basis data. Dengan mengimplementasikan aplikasi ini, diharapkan saya dapat membantu proses pengambilan keputusan pemilihan asisten di Laboratorium Teknik Informatika Universitas Gunadarma.

Pada awal mengajukan judul, saya sangat gugup jika judul yang saya ajukan tidak diterima. Ternyata dosen pembimbing saya sangat menyetujui judul yang saya ajukan. Beliau mengatakan juga bahwa judul saya mungkin bisa digunakan oleh staff Laboratorium Teknik Informatika nantinya. Dosen pembimbing saya juga menyarankan untuk membuat surat izin yang ditujukan kepada pihak Laboratorium Teknik Informatik dalam pengambilan data maupun prosedur penerimaan asisten laboratorium.

Karena saya kurang memahami bahasa pemrograman, saya mencoba menghubungi teman saya untuk membantu saya dalam membuat aplikasi ini. Alhamdulillah, teman saya bersedia membantu dan saya mulai mencari buku-buku yang dapat mendukung pembuatan aplikasi saya. Proses pembuatan masing-masing bab tidak semulus yang saya harapkan. Keterbatasan waktu dosen pembimbing, konsultasi dengan Ketua Laboratorium Teknik Informatika, dan jumlah mahasiswa  yang harus datang saat konseling menjadikan faktor penghambat selesainya bab penelitian saya. Di samping revisi yang banyak juga membuat saya sedikit putus asa untuk meneruskan penelitian saya.

Teman saya selalu mengingkatkan kalau saya tidak boleh berhenti mencoba. Kalau kita sudah menargetkan sesuatu selesai, maka harus diselesaikan. Kalau bukan saya yang menyelesaikan, lalu siapa lagi. Akhirnya saya mencoba mengumpulkan semangat untuk mengerjakan aplikasi kembali. Buku demi buku saya baca, konsultasi demi konsultasi saya jalani. Perpustakaan demi perpustakaan saya kunjungi demi tercapainya target.

Sebelumnya, saya memang optimis kalau saya menargetkan akan menyelesaikan penelitian saya dalam waktu satu hingga dua bulan. Namun, pada kenyataannya, dalam waktu tersebut saya hanya menyelesaikan sampai Bab II dan belum membuat Bab III. Bab yang paling membuat mahasiswa malas untuk membuatnya, karena isi dari bab ini adalah yang paling penting dalam pembuatan aplikasi. Mulai dari cara pembuatan, proses, hingga output yang dihasilkan.

Bermodalkan niat, usaha, dan doa saya mencoba perlahan-lahan membuat Bab III. Saya pun meminta Bab III teman saya untuk dijadikan bahan acuan pembuatan bab ini. Ternyata untuk membuat satu halaman website saja membutuhkan waktu yang tidak sedikit. Terlebih jika ada pesan error pada program. Saya harus mencari letak kesalahan program dan membetulkannya.

Alhamdulillah, dalam waktu kurang lebih dua minggu saya dapat menyelesaikan Bab III. Tapi saya belum merasa tenang, karena masih terdapat revisi yang cukup banyak pada Bab III saya. Selama satu minggu saya memperbaiki Bab III. Sudah hampir tiga bulan saya belum menyelesaikan penulisan saya. Melihat teman-teman yang sudah  sidang, membuat saya merasa iri ingin cepat-cepat menyelesaikan penelitian saya. Terlebih, akan menjadi beban jika saya harus menyelesaikannya pada semester tujuh.

Tahap demi tahap, bab per bab saya kerjakan hingga akhirnya saya tiba pada tahap pengajuan tanggal sidang. Saya merasa sedikit lega karena penulisan ilmiah saya akhirnya selesai. Walaupun pada proses pembuatannya sulit, namun selama prosesi sidang alhamdulillah sangat dimudahkan oleh dosen penguji. Setelah keluar dari ruang sidang, saya sangat senang sekali. Saya sangat yakin akan mendapat nilai yang baik untuk mata kuliah Penelitian Ilmiah.

Kesimpulannya dalam segala kesulitan yang kita hadapi, teruslah berusaha dan berdoa kepada Yang Maha Kuasa. Karena, tanpa itu kita tidak akan sanggup menghadapi segala sesuatunya. Di samping itu, kita juga harus bisa fokus terhadap apa yang kita targetkan, buang jauh-jauh segala sesuatu yang dapat mengganggu konsentrasi kita dalam mencapai tujuan tertentu.

KERANGKA ACUAN KERJA (KAK) INTERNET SERVICE PROVIDER “RUNNING NET”

 

1. LATAR BELAKANG Perkembangan dunia internet pada saat ini telah mencapai suatu tahap yang begitu cepat, sehingga tidak mengherankan apabila di setiap sudut kota banyak ditemukan tempat-tempat yang menyajikan berbagai jasa pelayanan internet.

 

2. MAKSUD DAN TUJUAN

 

 

 

 

a.   Membangun provider “RUNNNING NET” yang dapat memberikan kesempatan kepada masyarakat luas untuk mendapatkan akses internet yang murah dengan cara swadaya.

b.   Membangun infrastruktur jaringan secara swadaya, Membangun aplikasi di lingkungan “RUNNING NET” yang bersangkutan, dan merawat dan mengembangkan jaringan yang sudah ada

 

3. TARGET/SASARAN

 

Masyarakat yang tinggal di daerah Margonda dan sekitarnya pada radius +5km2, pemilik hotel dan kantor-kantor, pemilik tempat kost mahasiswa/mahasiswi, pemilik warnet, dan pelajar di sekitarnya.

 

4. NAMA ORGANISASI PENGADAAN BARANG/JASA

 

Usaha  yang  dikembangkan  diberi  nama  “EXTRAFASTNET”  dengan  badan  usaha berbentuk CV yang didaftarkan ke notaris sehingga memiliki badan hukum yang tetap.

 

5.   PERKIRAAN BIAYA  

1

6. RUANG LINGKUP  PENGADAAN/ LOKASI DAN FASILITAS PENUNJANG

 

a.   Ruang lingkup pekerjaan/pengadaan dekat dengan kawasan perumahan modern,  dekat  dengan  wilayah  pendidikan  baik  itu  Perguruan  Tinggi,  Sekolah  Menengah Umum, dan Sekolah Menengah Pertama,  daerah atau kawasan kos-kosan mahasiswa.

b.   Lokasi pekerjaan/pengadaan berada di daerah tinggi.

 

7. TENAGA TERAMPIL YANG DIBUTUHKAN

 

Tenaga terampil yang dibutuhkan meliputi :

§  Pegawai minimal tamat D3, S1 lebih diutamakan.

§  Memiliki pengalaman dalam menangani permasalahan komputer dan jaringan.

§  Membutuhkan ± 50 pegawai.

 

8.SPESIFIKASI TEKNIS

 

Spesifikasi teknis yang diperlukan, meliputi:

Tower Triangle,  Akses Point,  Router,  Switch 24 Port,  Antena Grid 24 db,  Antena Omni,  Kabel UTP,  Toolkit (obeng,tang, pemotong),  Komputer + Meja,  Kabel Coak,  Sewa Ruangan,  Listrik,  Alat-Alat Listrik,  Bayar Tukang,  Kursi Lipat,  Rak/Lemari Server,  Bandwidth.

 

9. LAPORAN KEMAJUAN PEKERJAAN

 

 

 

Laporan yang dibuat meliputi :

§  Laporan harian;

§  Laporan mingguan;

§  Laporan bulanan;

Isi laporan menyangkut tentang kemajuan pekerjaan yang telah dilaksanakan, penggunaan bahan/material serta peralatan yang digunakan dan kendala dan pemecahan masalah yang dilakukan.

Gambaran Umum Rencana Bisnis :

EXTRAFASTNET merupakan perusahaan yang memberikan layanan ke seluruh Indonesia. Perusahaan ini bergerak di bidang jasa Internet Service Provider yang menggunakan teknologi wireless agar client bisa menghubungkan komputernya dengan internet tanpa menggunakan kabel. Perusahaan ini menyedikan layanan internet local maupun internasional.  Layanan internet yang diberikan, diantaranya browsing dengan cepat, streaming tanpa buffer, download dengan kecepatan 10Mbps, upload dengan kecepatan 5Mbps, dan online games.

Komentar :

Di zaman yang serba modern seperti sekarang ini, kebutuhan akan informasi diharuskan serba cepat dan efisien. Hal ini menyebabkan manusia sebagai pelaku utama dari kemajuan teknologi dan informasi, dituntut untuk mendapatkan informasi yang terbaru. Di samping tuntutan informasi yang semakin berkembang, kita juga menginginkan fasilitas yang memudahkan untuk mendapatkan informasi tersebut.

Dengan adanya internet, segala kebutuhan yang kita perlukan sudah tersedia. Kita dapat mengakses di mana saja dan kapan saja secara mudah tanpa harus mengeluarkan energi yang banyak. Keberadaan ISP ini sendiri dinilai sangat membantu kita dalam mendapatkan informasi. Dengan akses yang cepat dan mudah membuat kita sebagai pengguna informasi merasa puas dan senang dengan layanan yang diberikan.